После захвата Красной Армией островов Шумшу и Парамушира, войска Тихоокеанского флота приступили к занятию остальных Курильских островов. Острова от Парамушира до Онекотана включительно занимались кораблями Камчатской военно-морской базы и Камчатского оборонительного района, участвовавшими в сражении за Шумшу. 25 августа перед высаженными советскими войсками капитулировали без боя гарнизоны островов Анциферова, Маканруши, Онекотан, Матуа в плен попало 3 795 человек. 30 августа была принята капитуляция гарнизона острова Уруп — 5600 солдат и офицеров. Некоторые гарнизоны, например, с острова Симушир, японцы успели вывезти в Японию. Всего на северных островах Курильской гряды было разоружено и пленено 30 442 японца, в том числе четыре генерала и 1 280 офицеров. Кроме того, на этих островах оказалось 2 212 человек мирного населения, которых затем по условиям капитуляции были репатриировали на Хоккайдо.
Высадка десанта на Курилах.
Для занятия южных Курильских островов были выделены 355-я стрелковая дивизия, 113-я стрелковая бригада и артиллерийский полк. Основные пункты высадки — Итуруп и Кунашир, затем — острова Малой Курильской гряды. Отряды кораблей с десантом должны были выходить из порта Отомари на Сахалине. Первым был занят остров Уруп. К нему вышел из Отомари 27 августа отряд кораблей в 2 тральщика с 2 стрелковыми ротами на борту — в целом 344 человека. 28 августа отряд прибыл к острову и принял капитуляцию главных сил японской 129-й пехотной бригады во главе с её командиром генерал-майором Нихо Сусуми. Также 28 августа 2 тральщика с десантом в 1079 человек подошли к острову Итуруп. Там капитулировали основные силы 89-й пехотной дивизии — 13500 солдат и офицеров во главе с её командиром генерал-лейтенантом Кэнносукэ Огавой.
1 сентября несколько отрядов кораблей с десантом в 4300 человек прибыли на остров Кунашир, где японский гарнизон насчитывал лишь 1250 человек. Столь большие силы были выделены на Кунашир, так как там планировалось создание военно-морской базы и с него должны были действовать десанты по занятию соседних островов. Также 1 сентября был занят остров Шикотан. Минный заградитель «Гижига» и два тральщика доставили стрелковый батальон в 830 человек с двумя орудиями. Японский гарнизон численностью 4800 бой не принял. Уже в начале сентября советскими моряками были заняты морскими десантами остальные острова Малой Курильской гряды: 2 сентября — остров Акиюри, 3 сентября — острова Юри, Сибоцу и Тараку, 4 сентября — остров Тодо. Гарнизоны этих островов состояли от 10 до 400 человек.
Капитуляция японского гарнизона острова Матуа перед советскими войсками.
Всего на южных Курилах перед советскими войсками капитулировали около 20 тысяч японских солдат и офицеров. Боевых действий при этом не было. Имели место несколько мелких инцидентов с нарушениями условий капитуляции. После боёв на Шумшу Тихоокеанский флот не понёс боевых потерь в районе Курильских островов. В общей сложности на Курильских островах было разоружено и пленено 50 тысяч японских солдат и офицеров, в их числе 4 генерала. Ещё около 10 тысяч человек японское командование успело эвакуировать в Японию. Изначально запланированная высадка на Хоккайдо была отменена по личному указанию И. В. Сталина. Таким образом, проведение Курильской десантной операции позволило занять советскими войсками 56 островов Курильской гряды, общей площадью 10,5 тыс. км², которые позднее, в 1946 году, были включены в состав СССР.